В июне я разрабатывал сервис для анализа генома. Это вторая часть рассказа о работе.

Отчёт   Интерфейс приложения и фильтров

Айбином — веб-приложение для анализа генома. Чтобы повысить доверие лабораторий к Айбиному, мы улучшили внешний вид приложения и упростили интерфейс.

Старая версия

Главная страница теперь не файловый менеджер с результатами анализа, а список пациентов:

Загрузка файлов и создание нового пациента:

В результатах анализа избавились от горизонтальной прокрутки и вынесли фильтры на видное место:

Старый фильтр

Даже страница с технической информацией отражает подход компании:

Старт проекта: 17 июня. Финиш: 7 июля.
После 7 июля потратили ещё 3 дня на тестирование. В следующих проектах добавим обязательную неделю на тесты.


Отзыв Андрея Афанасьева о работе
Это первый проект iBinom с Вадимом Юмадиловым. В целом, нам понравилось и хотим работать дальше. Вадим оказался очень искренним и вовлеченным человеком, сразу рассказал о возможных недостатках работы и собственной неидеальной внимательности (что пару раз проявилось в проекте), а также продемонстрировал отличные когнитивные и коммуникативные способности. Разобраться в биоинформатике за пару недель и понять что важно, а что нет общаясь с пятью разными членами команды — такого я еще не видел.

В целом, была решена главная задача — сделать сайт солидным, понятным врачам и удобным в использовании. Было приятно, что появился даже тот функционал, который мы не обсуждали заранее.

Подход ФФФ нам понравился, все было готово с небольшим опозданием относительно договоренного срока.

Но с встраиванием написанного кода возникло много проблем — до сих пор правим баги в странной смеси ангуляра и jQuery. Правда, это скорее не к Вадиму, а к его партнеру.

Саша Беспоясов о вёрстке Айбинома

Команда
Дизайнер — Вадим Юмадилов
Технолог — Александр Беспоясов
Бекенд — Илья Китаев (Айбином)

Спасибо Андрею Афанасьеву, Александре Вачнадзе, Василию Ситнику и Владимиру Наумову за помощь и консультации.

В июне я разрабатывал сервис для анализа генома. Это первая часть рассказа о работе.

Отчёт   Интерфейс приложения и фильтров

Айбином — сервис для анализа генома, который помогает найти наследственные заболевания. Исследователь сканирует геном, запускает анализ и распечатывает отчёт с мутациями.

Первым делом мы улучшили отчёт — по нему судят о качестве сервиса. Уменьшили длину отчёта с десяти страниц до трёх, уместили данные из 40-колоночной таблицы на А4:

Таблица из старого отчёта

Об опасности заболевания судят по распространённости мутации и оценкам баз данных. Визуализации оценок помогают исследователю сравнивать мутации между собой. Система упорядочивает оценки, но не навязывает решение. Опасность мутации определяет исследователь, а не система.

Оценка базы данных
У мутаций есть набор оценок от разных баз данных. Чтобы соотнести оценки было проще, мы отображаем их на шкале с шариками. Разброс оценок от 0 до 60. Чем выше оценка, тем правее шарик и опаснее мутация.

Распространённость
Распространённость мутации — это маленькие дробные числа от 0 до 1. Чтобы отличия между числами были заметными, мы придумали веерную визуализацию. Одна прямая — одно число. Угол наклона прямой — арксинус от числа. Чем меньше угол наклона, тем опаснее мутация.

Ещё картинка напоследок: